| 所属学院 | 专业名称 |
| 第一临床学院 （网址：http://www.hospital-cqmu.com/ ） | 临床医学“5+3”一体化 |
| 临床医学 |
| 麻醉学 |
| 精神医学 |
| 医学影像技术 |
| 听力与言语康复学 |
|
| 第二临床学院 （网址：http://www.sahcqmu.com/） | 临床医学“5+3”一体化 |
| 临床医学 |
| 医学影像学 |
| 康复治疗学 |
|
| 第五临床学院 （网址：https://www.ychcqmu.com/） | 临床医学（定向培养） |
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| 儿科学院 （网址：http://www.chcmu.com/） | 临床医学“5+3”一体化（培养方向：儿科学） |
| 儿科学 |
|
| 口腔医学院 （网址：https://www.cqdent.com/） | 口腔医学 |
| 口腔医学技术 |
|
| 护理学院 （网址：http://nursing.cqmu.edu.cn/） | 护理学 |
|
| 基础医学院 （网址：http://basic.cqmu.edu.cn/） | 基础医学 |
| 法医学 |
| 医学实验技术 |
| 生物信息学 |
|
| 检验医学院 （网址：http://jyx.cqmu.edu.cn/） | 医学检验技术 |
|
| 药学院 （网址：http://yxy.cqmu.edu.cn/） | 药学 |
| 临床药学 |
| 药物制剂 |
|
| 中医药学院 （网址：http://zyy.cqmu.edu.cn/） | 中医学（定向培养） |
| 中医学 |
| 针灸推拿学 |
| 中西医临床医学 |
| 中药学 |
| 中药制药 |
|
| 公共卫生与管理学院 （网址：http://gwgl.cqmu.edu.cn/） | 预防医学 |
| 食品卫生与营养学 |
| 卫生检验与检疫 |
| 应用统计学 |
| 公共事业管理 |
|
| 生物医学工程学院 （网址：http://swyxgcxy.cqmu.edu.cn/） | 生物医学工程 |
|
| 医学信息学院 （网址：http://mi.cqmu.edu.cn/） | 医学信息工程 |
| 信息管理与信息系统 |
| 智能医学工程 |
|
| 外国语学院 （网址：http://foreign.cqmu.edu.cn/） | 英语 |
|
| 国际医学院 （网址：http://imc.cqmu.edu.cn/） | 临床医学（中外合作）新增 |
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